Fakültemizdeki bazı birimler 13 Eylül 2019 Cuma ve 14 Eylül 2019 Cumartesi günü olmak üzere iki kısım halinde M.Ü. Recep Tayyip Erdoğan Külliyesi’ndeki yeni binasına taşınmıştır. Dekanlık ve idari bürolar, Eczacılık İşletmeciliği, Klinik Eczacılık, Eczacılık Temel Bilimleri ve Biyokimya Anabilim Dalı, uygulama eczanesi, kütüphane, okuma salonu, öğrenci klüpleri, eczacılık müzesi, bilgisayar laboratuvarı, amfiler ve derslikler yeni binada yer almaktadır. 23 Eylül 2019 tarihinden itibaren yeni binada dersler, Haydarpaşa binasında ise öğrenci laboratuvarları yapılacaktır.